MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 plasmid pS19502

Total Repeats: 1162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009999	TAT	2	6	148	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873003
2	NC_009999	GCT	2	6	233	238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873003
3	NC_009999	AAG	2	6	399	404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873003
4	NC_009999	CTAA	2	8	548	555	50 %	25 %	0 %	25 %	160873003
5	NC_009999	ATG	3	9	573	581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
6	NC_009999	AGGCA	2	10	685	694	40 %	0 %	40 %	20 %	160873003
7	NC_009999	CGC	2	6	768	773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160873003
8	NC_009999	AAG	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873003
9	NC_009999	ATG	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
10	NC_009999	TC	3	6	881	886	0 %	50 %	0 %	50 %	160873003
11	NC_009999	AAT	2	6	926	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160873003
12	NC_009999	CCA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160873003
13	NC_009999	AGC	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873003
14	NC_009999	CTA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873003
15	NC_009999	ACT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873003
16	NC_009999	CTG	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873003
17	NC_009999	TGA	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
18	NC_009999	GC	3	6	1194	1199	0 %	0 %	50 %	50 %	160873003
19	NC_009999	GTA	2	6	1238	1243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
20	NC_009999	GGA	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160873003
21	NC_009999	GAT	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
22	NC_009999	AGGT	2	8	1435	1442	25 %	25 %	50 %	0 %	160873003
23	NC_009999	GCG	2	6	1456	1461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160873003
24	NC_009999	TCG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873003
25	NC_009999	GGAGC	2	10	1606	1615	20 %	0 %	60 %	20 %	160873003
26	NC_009999	AGA	2	6	1744	1749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873003
27	NC_009999	T	7	7	1762	1768	0 %	100 %	0 %	0 %	160873003
28	NC_009999	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873003
29	NC_009999	GCT	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873003
30	NC_009999	TAT	2	6	1908	1913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873003
31	NC_009999	GAAGTT	2	12	1961	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
32	NC_009999	TAC	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873003
33	NC_009999	AAC	2	6	2008	2013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873003
34	NC_009999	CCTA	2	8	2045	2052	25 %	25 %	0 %	50 %	160873003
35	NC_009999	CTTA	2	8	2128	2135	25 %	50 %	0 %	25 %	160873003
36	NC_009999	ATT	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873003
37	NC_009999	TGA	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
38	NC_009999	AGATAG	2	12	2259	2270	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	160873003
39	NC_009999	ATT	2	6	2302	2307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873003
40	NC_009999	TTGG	2	8	2400	2407	0 %	50 %	50 %	0 %	160873003
41	NC_009999	ATGGGT	2	12	2481	2492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	160873003
42	NC_009999	AAAAT	2	10	2508	2517	80 %	20 %	0 %	0 %	160873003
43	NC_009999	TGA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
44	NC_009999	GAT	2	6	2638	2643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
45	NC_009999	ATT	2	6	2651	2656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873003
46	NC_009999	A	6	6	2709	2714	100 %	0 %	0 %	0 %	160873003
47	NC_009999	CTG	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873003
48	NC_009999	AG	3	6	2848	2853	50 %	0 %	50 %	0 %	160873003
49	NC_009999	CCG	2	6	2868	2873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160873003
50	NC_009999	TGA	2	6	2881	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
51	NC_009999	GAG	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160873003
52	NC_009999	TGC	2	6	3010	3015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873003
53	NC_009999	TGA	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
54	NC_009999	GCTT	2	8	3082	3089	0 %	50 %	25 %	25 %	160873003
55	NC_009999	TCA	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873003
56	NC_009999	TAG	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
57	NC_009999	A	6	6	3305	3310	100 %	0 %	0 %	0 %	160873003
58	NC_009999	TGA	2	6	3349	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
59	NC_009999	AAC	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873003
60	NC_009999	ATCAG	2	10	3499	3508	40 %	20 %	20 %	20 %	160873003
61	NC_009999	AGA	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873003
62	NC_009999	TCT	2	6	3620	3625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873003
63	NC_009999	TGTA	2	8	3693	3700	25 %	50 %	25 %	0 %	160873003
64	NC_009999	ACTT	2	8	3792	3799	25 %	50 %	0 %	25 %	160873003
65	NC_009999	GAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873003
66	NC_009999	ACT	2	6	3937	3942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873003
67	NC_009999	GAA	2	6	3983	3988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873003
68	NC_009999	AG	3	6	3992	3997	50 %	0 %	50 %	0 %	160873003
69	NC_009999	CAT	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873003
70	NC_009999	TGG	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873003
71	NC_009999	AAGA	2	8	4101	4108	75 %	0 %	25 %	0 %	160873003
72	NC_009999	ATG	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
73	NC_009999	ATG	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873003
74	NC_009999	TAGG	2	8	4254	4261	25 %	25 %	50 %	0 %	160873003
75	NC_009999	ATGCA	2	10	4791	4800	40 %	20 %	20 %	20 %	160873004
76	NC_009999	CTG	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873004
77	NC_009999	TTG	2	6	4874	4879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873004
78	NC_009999	TA	3	6	4938	4943	50 %	50 %	0 %	0 %	160873004
79	NC_009999	GAA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873005
80	NC_009999	GGAA	2	8	5195	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	160873005
81	NC_009999	AGA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873005
82	NC_009999	TGA	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873005
83	NC_009999	GAAA	2	8	5298	5305	75 %	0 %	25 %	0 %	160873005
84	NC_009999	A	6	6	5310	5315	100 %	0 %	0 %	0 %	160873005
85	NC_009999	CTT	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160873005
86	NC_009999	GA	3	6	5334	5339	50 %	0 %	50 %	0 %	160873005
87	NC_009999	GAA	2	6	5549	5554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160873006
88	NC_009999	AAGG	2	8	5562	5569	50 %	0 %	50 %	0 %	160873006
89	NC_009999	TCGT	2	8	5590	5597	0 %	50 %	25 %	25 %	160873006
90	NC_009999	GTGAC	2	10	5740	5749	20 %	20 %	40 %	20 %	160873006
91	NC_009999	GTG	2	6	5787	5792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873006
92	NC_009999	TAA	2	6	5869	5874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160873006
93	NC_009999	GTT	2	6	6024	6029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873006
94	NC_009999	CAAC	2	8	6078	6085	50 %	0 %	0 %	50 %	160873006
95	NC_009999	GTG	2	6	6237	6242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160873007
96	NC_009999	CGT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873007
97	NC_009999	ATG	2	6	6534	6539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873008
98	NC_009999	GCT	2	6	6540	6545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873008
99	NC_009999	A	6	6	6584	6589	100 %	0 %	0 %	0 %	160873008
100	NC_009999	AGC	2	6	6606	6611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873008
101	NC_009999	CCA	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160873008
102	NC_009999	GTT	2	6	6661	6666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873008
103	NC_009999	ATG	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873008
104	NC_009999	TGA	2	6	6736	6741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873008
105	NC_009999	GCT	2	6	6770	6775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873008
106	NC_009999	TCG	2	6	6808	6813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873008
107	NC_009999	TG	3	6	6841	6846	0 %	50 %	50 %	0 %	160873008
108	NC_009999	TGA	2	6	6979	6984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873008
109	NC_009999	ACTG	2	8	7006	7013	25 %	25 %	25 %	25 %	160873008
110	NC_009999	T	6	6	7086	7091	0 %	100 %	0 %	0 %	160873008
111	NC_009999	CGAA	2	8	7102	7109	50 %	0 %	25 %	25 %	160873008
112	NC_009999	AGC	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160873008
113	NC_009999	T	6	6	7176	7181	0 %	100 %	0 %	0 %	160873008
114	NC_009999	ACA	2	6	7225	7230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160873008
115	NC_009999	GCC	2	6	7247	7252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160873008
116	NC_009999	GCG	2	6	7256	7261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160873008
117	NC_009999	CGC	2	6	7320	7325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160873008
118	NC_009999	A	6	6	7349	7354	100 %	0 %	0 %	0 %	160873008
119	NC_009999	GTT	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873008
120	NC_009999	TGA	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160873008
121	NC_009999	TG	3	6	7395	7400	0 %	50 %	50 %	0 %	160873008
122	NC_009999	CTG	2	6	7401	7406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873008
123	NC_009999	TAT	2	6	7448	7453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160873008
124	NC_009999	GCTT	2	8	7467	7474	0 %	50 %	25 %	25 %	160873008
125	NC_009999	GTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160873008
126	NC_009999	CGC	2	6	7644	7649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160873008
127	NC_009999	ACT	2	6	7655	7660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873008
128	NC_009999	A	6	6	8300	8305	100 %	0 %	0 %	0 %	160873009
129	NC_009999	ATC	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873009
130	NC_009999	TGC	2	6	8353	8358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873009
131	NC_009999	TAC	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160873009
132	NC_009999	GC	4	8	8417	8424	0 %	0 %	50 %	50 %	160873009
133	NC_009999	A	7	7	8426	8432	100 %	0 %	0 %	0 %	160873009
134	NC_009999	GCT	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160873009
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